В нижеприведенном примере мы будем выполнять действия над вложенными объектами текущей папки, присваивать всем файлам права на чтение/запись/выполнение – 666, а папкам – 777 и выводить их список на экран.

function rdir ($path2dir) {
    $d = dir ($path2dir);  

    while (false !== ($entry = $d->read())) {  

        if ($entry!='.' && $entry!='..' && $entry!='' ) {
            $all_path = $path2dir.$entry;
            $new_path = go ($all_path, is_file($all_path));  

            if (!is_file($all_path)) {
                if (!rdir ($new_path)) {
                    return false;
                }
            }
        }
    }  

    return true;
}

function go ($path2file, $is_file = true) {  

    if ($is_file) {  

        # выполняем операцию над файлом
        # выведем относительный путь к обрабатываемому файлу
        echo $path2file,"\n";  

        # установим необходимые права на файл
        if (!chmod($path2file,0666)) {
            return false;
        }  

    } else {  

        # выполняем операцию над папкой
        $path2file = $path2file.'/';  

        # выведем относительный путь к обрабатываемой директории
        echo "\n\n",$path2file,"\n";  

        # установим необходимые права на папку
        if (!chmod($path2dir,0777)) {
            return false;
        }
    }  

    return $path2file;
}

# начинаем с текущей папки
$folder = './';  

# непосредственно вызываем функцию
if (rdir ($folder)) {
    echo 'DONE';
}